Différents conseils assurent la gouvernance de l'esä Dunkerque-Tourcoing :

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- le Conseil d'Administration ;

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- le Conseil de la Pédagogie et de la Vie Étudiante (CPVE) ;

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- le Conseil scientifique ;

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- le Conseil de Perfectionnement.

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À ces quatre conseils, on peut ajouter :

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- le Conseil de discipline ;

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- le Règlement des études.